Расшифрован геном гавайской вороны для помощи в сохранении вида

Ученые из San Diego Zoo Global и Университета Гавайев в Хило в сотрудничестве с PacBio полностью секвенировали геном 'Алала, или гавайской вороны, и представили результаты на конференции Plant and Animal Genomics XXIV в Сан-Диего. Популяция 'Алала ранее сократилась примерно до 20 птиц, и секвенирование генома вида будет важно для отслеживания возможных генетических проблем из-за сниженного генетического разнообразия.

"В наших усилиях по возвращению видов с грани исчезновения мы работали с рядом видов, прошедших через генетическое "бутылочное горлышко", что, возможно, снизило генетическую приспособленность вида из-за ограниченного оставшегося генетического разнообразия", — сказал Оливер Райдер, генетик San Diego Zoo Global. — "Детальное знание генетической картины 'Алала поможет нам понять вызовы, с которыми сталкивается этот вид на пути к восстановлению".

Секвенирование генома происходит в начале того, что, как надеются, станет важным годом для гавайской вороны. Экологи планируют вновь интродуцировать этот вид в подготовленную среду обитания на острове Гавайи позже в этом году. 'Алала исчезла в дикой природе с 2002 года и сохранялась только в программе San Diego Zoo Global в их птичьих центрах на Гавайях.

"Мы много лет работали над созданием достаточно большой — и генетически разнообразной — популяции, чтобы начать возвращать 'Алала в дикую природу", — сказал Брайс Масуда, руководитель программы сохранения Гавайской программы по охране исчезающих птиц. — "Мы достигли нашей цели и теперь готовимся выпустить птиц в дикую природу в 2016 году".

Целью программы было увеличение стаи 'Алала до 75 или более особей перед выпуском в их родные леса на острове Гавайи. 'Алала, член семейства врановых, была доведена до грани исчезновения из-за потери среды обитания, а также завезенных хищников и болезней. Для видов, находившихся на грани исчезновения, генетическая приспособленность и информация, хранящаяся в их геноме, могут оказаться важным инструментом в борьбе за их спасение.

"Изучение генома вида может помочь нам лучше понять, как этот вид будет взаимодействовать со своей естественной средой обитания и возвращаться в нее", — сказала Джолен Саттон, доцент Университета Гавайев в Хило. — "Благодаря научному сотрудничеству с PacBio у нас теперь есть карта ДНК 'Алала, которая может оказаться решающей для их долгосрочного восстановления. Мы в полном восторге от качества секвенирования и уже определили несколько локусов генов, которые, как мы думаем, могут существенно повлиять на успех реинтродукции".