Расшифрован геном загадочной бактерии кандидатного филума TM6

Исследователи из Института Крейга Вентера впервые секвенировали геном бактерии из кандидатного филума TM6. Образец был обнаружен в виде биоплёнки в сливе раковины в больничном туалете.

TM6 — одна из некультивируемых в лаборатории бактерий, которую называют «тёмной материей» жизни. Её следы находят в системах очищенной воды по всему миру, но изучить её до сих пор не удавалось.

Метод исследования:

1. Образец биоплёнки из слива раковины содержал множество бактерий.
2. Клетки TM6 пометили флуоресцентным маркером и отделили от других.
3. Из отдельных клеток извлекли ДНК.
4. Сравнение с ДНК известных бактерий подтвердило уникальность образца и помогло в секвенировании.

Результаты:

• Удалось собрать около 90% генома бактерии.
• Установлено, что TM6 не способна самостоятельно синтезировать аминокислоты, что указывает на зависимость от хозяина.
• Предположительно, бактерия живёт за счёт амёбы или другой бактерии.

Значение и перспективы:

Пока неизвестно, представляет ли TM6 опасность для человека. Однако другие бактерии, использующие амёб в качестве хозяев, могут быть патогенными. Расшифровка генома значительно повышает шансы на успешное культивирование TM6 в лаборатории, что необходимо для её всестороннего изучения.