Учёные расшифровали генетическое происхождение культурной земляники
Учёные из Университета Нью-Гэмпшира раскрыли важную генетическую загадку одного из предков культурной земляники. Четырёхлетний генетический анализ, проведённый исследователями Нью-Гэмпширской сельскохозяйственной опытной станции, направлен на улучшение современных методов выращивания.
Исследование дикого предка
Объектом исследования стал дикий предок культурной земляники — Fragaria iinumae. Этот вид, как и человек, имеет два набора хромосом (диплоидный), в то время как культурная земляника имеет восемь наборов и является одним из самых генетически сложных растений.
Создание генетической карты
Учёные, включая Томаса Дэвиса и Лиз Махоуни, построили карту сцепления семи хромосом диплоидной Fragaria iinumae. Это помогает заполнить пробел в понимании генетики восьми наборов хромосом культурной земляники, чьё происхождение, как полагают, восходит к четырём диплоидным предкам, включая F. iinumae.
«Определение геномов диких предков культурной земляники в конечном итоге поможет направлять использование генетической информации в селекции для получения лучшей культурной земляники», — пояснила Лиз Махоуни.
Значение для науки и селекции
Это вторая расшифровка генома диплоидного предка после Fragaria vesca в 2011 году. Новая карта — самая высокодетальная для любого диплоидного предка земляники — станет ключевым ресурсом для сборки референсного генома F. iinumae.
Для создания карты использовался инструмент IStraw90 SNP array, разработанный при участии лаборатории Дэвиса. Это позволяет перейти от трудоёмкой оценки физиологических признаков у сотен растений к маркер-опосредованной селекции на основе генетического состава.
«UNH входит в очень небольшое число учреждений мира, работающих на переднем крае геномики земляники. Мы разрабатываем новые сорта, адаптированные для местных условий и органического производства», — отметила Махоуни.
Исследование опубликовано в журнале The Plant Genome.
Контекст: США — мировой лидер по производству земляники (свыше 3 млрд фунтов стоимостью $2.4 млрд в 2012 году). В Нью-Гэмпшире стоимость урожая оценивается примерно в $1.85 млн.