Использование эволюции для идентификации типов клеток

Журнал Science освещает новый подход к определению типов клеток, основанный на работе недавней исследовательской группы в Институте Санта-Фе (SFI).

Биологи, собравшиеся на рабочую группу «Типы клеток и происхождение типов клеток» в октябре, обсудили «другую, более надежную концепцию» классификации клеток, как цитирует в Science системного биолога и участницу группы Стефани Виддер. Группа была организована в рамках сотрудничества между Институтом Санта-Фе и Центром биосоциальных сложных систем Университета штата Аризона.

Вместо традиционного подхода, основанного на структуре, функции или расположении клетки в организме, группа использовала эволюционный подход к классификации. Он фокусируется на паттернах экспрессии генов, которые показывают, какие части генома клетки активны. Эти характерные паттерны активности могут указывать на разное эволюционное происхождение внешне похожих клеток.

В статье Science приведены примеры:

• Классификация схожих клеток в человеческом мозге и репродуктивном тракте.
• Разграничение различной эволюционной истории нейронов в пределах одной нервной системы.
• Определение того, указывает ли сходство клеток у разных видов (например, поперечнополосатых мышечных клеток у позвоночных и стрекающих (медуз)) на их «эволюционную связь».

Участники рабочей группы готовят обзорную статью, которая разъяснит, как понимать клетки через паттерны экспрессии генов, и преимущества такого эволюционного подхода.