Новый метод мониторинга eDNA для выявления редких и исчезающих видов рыб на рынках
Исследователи из Лаборатории судебной экспертизы в области охраны природы Гонконгского университета представили новый мощный инструмент для мониторинга торговли редкими и исчезающими видами рыб на гонконгских "мокрых рынках". Используя экологическую ДНК (eDNA) из сточных вод рынков, они смогли выделить и секвенировать достаточно ДНК для идентификации более 100 видов рыб, прошедших через рынок.
Методом eDNA были обнаружены различные уязвимые или исчезающие виды, в том числе:
- Epinephelus fuscoguttatus (коричневый мраморный групер) — статус "уязвимый" по МСОП.
- Три вида угрей: Anguilla japonica и Anguilla rostrata (статус "исчезающие" по МСОП), а также Anguilla anguilla (европейский угорь), внесенный в список СИТЕС.
- Два вида морских лещей: Nemipterus virgatus ("уязвимый") и Acanthopagus sivicolus ("уязвимый").
Метод: метабаркодирование по eDNA из стоков
Исследователи сравнили два основных метода сбора eDNA из дренажных вод трех рынков:
- Фильтрация: 1 литр воды пропускался через тонкий фильтр, улавливающий ткани и клеточный материал.
- Осаждение: eDNA химически осаждали всего из 45 мл сточной воды.
После сбора eDNA экстрагировали и проводили метабаркодирование — массовое секвенирование "штрих-кодов" ДНК для одновременной идентификации множества видов. Результаты сравнили с визуальным обследованием, проведенным экспертом-таксономистом.
Преимущества метода
- Надежность: ДНК-идентификация точнее морфологической, особенно когда рыба продается разделанной или виды внешне схожи.
- Эффективность: Метод требует всего несколько часов базовой молекулярной подготовки, в отличие от многих часов работы экспертов-таксономистов при визуальном обследовании.
- Практичность: Продавцы часто неохотно допускают длительный осмотр товара, а сбор проб воды — ненавязчивая процедура.
Как отметил соавтор работы Джон Л. Ричардс, метод может побудить власти внедрять высокотехнологичные решения для мониторинга и борьбы с незаконной торговлей, а также расширить использование eDNA и метабаркодирования в городских условиях.