Обнаружение патогенов лягушек с помощью eDNA: новый инструмент для сохранения видов

Исследователи из Мельбурнского университета и Университета Питтсбурга (США) установили, что болезни, поражающие лягушек, можно обнаружить в образцах окружающей среды, таких как почва и вода. Это помогает защитникам природы в борьбе с сокращением популяций амфибий.

Что такое eDNA и в чём его преимущество?

Экологическая ДНК (eDNA) — это образцы, которые можно найти в окружающей среде (почве, воде), а не брать напрямую у конкретного вида. Использование eDNA имеет серьёзные преимущества, когда отлов и тестирование животных, особенно находящихся под угрозой исчезновения, крайне затруднены.

Проблема Австралии и поиск решений

Доктор Лора Браннелли отметила важность определения возможностей и ограничений метода eDNA для обнаружения патогенов. В Австралии патогены уничтожают многих местных лягушек, таких как Corroboree frog и Baw Baw frog. Необходимы новые способы обнаружения угроз в их среде обитания для разработки защитных мер.

Исследуемый патоген: Batrachochytrium dendrobatidis (Bd)

Исследование было сосредоточено на грибке Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) — основной причине сокращения популяций лягушек во всём мире, вызывающем хитридиомикоз. С 1980-х годов стало ясно, что проблема не только в потере среды обитания, но и в занесении патогенов.

Результаты исследования: эффективность eDNA

• Водные образцы оказались так же эффективны для обнаружения Bd, как и мазки с кожи животных.
• Образцы почвы были полезны, но менее точны, чем вода и мазки.
• Ключевое ограничение: eDNA не позволяет точно оценить нагрузку патогена (его количество). Поэтому, хотя eDNA может обнаружить присутствие патогена, для оценки общего риска по-прежнему необходимы мазки с популяций лягушек.

Перспективы и применение

По словам доктора Браннелли, eDNA помогает отслеживать распространение патогена и потенциально прогнозировать вспышки смертности. Например, известно, что Bd лучше размножается в прохладных условиях, что можно учитывать при планировании мер.

Вывод: eDNA не должен заменять традиционное взятие мазков, но может служить важным первым шагом для мониторинга территорий и выявления зон, требующих более интенсивного наблюдения.

Широкие возможности метода

Техника eDNA применима и для других патогенов, влияющих на человека и сельское хозяйство. Например, её уже используют для обнаружения бычьего туберкулёза с целью оценки риска его передачи от диких животных сельскохозяйственным коровам.