Геном дуба доказывает свою ценность
Спустя полтора года после публикации генома дуба черешчатого Национальным исследовательским институтом сельского хозяйства, продовольствия и окружающей среды Франции (INRAE) и Комиссариатом по атомной и альтернативным видам энергии (CEA), первые результаты, основанные на этом геномном ресурсе, были опубликованы в выпуске New Phytologist от 16 апреля 2020 года.
Десять статей в этой подборке помогают прояснить эволюцию дубов — от глубоких корней их диверсификации до более поздней эволюции. Они также выявляют ключевые гены, участвующие в адаптации дуба к экологическим переходам и устойчивости к патогенам, исследуют последствия и историю гибридизации дубов и прослеживают геномные свидетельства примерно 56 миллионов лет эволюции дуба. Этот знаковый сборник будет ценен для ученых, изучающих деревья, по всему миру. Четыре статьи были написаны в соавторстве с исследователями из Мортонского дендрария.
Дубы являются ключевыми видами в широком спектре лесных и саванных экосистем по всему Северному полушарию. Они также служат модельными организмами для изучения экологических и эволюционных процессов, ответственных за диверсификацию и адаптацию растений, особенно в ответ на быстрые изменения окружающей среды. Учитывая высокую скорость глобального изменения климата, геномные подходы к пониманию реакции деревьев на окружающую среду особенно актуальны.
Сборник освещает несколько новых открытий в биологии деревьев, возникших в результате этих исследований, основанных на геноме дуба:
В обзоре исследований ранней и более поздней эволюции дубов предлагаются эволюционные механизмы, объясняющие высокое разнообразие и распространенность дубов по всему Северному полушарию (Kremer et Hipp, 2020).
Два глобальных филогеномных исследования воссоздают историю диверсификации дубов в Северном полушарии, раскрывая важную роль как видообразования, так и гибридизации в формировании разнообразия дубовых лесных сообществ (Crowl et al. 2020; Hipp et al. 2020).
Синтез геномных данных на фоне западных культурных традиций предполагает биологические основы традиционного использования дуба как символа долголетия, сплоченности и устойчивости (Leroy et al. 2020a).
Предлагается новая стратегия сохранения дубов, которая использовала бы преимущества гибридизации, чтобы облегчить способность этих долгоживущих организмов адаптироваться к глобальным изменениям путем естественного обмена полезными генами через видовые границы (Cannon and Petit, 2020).
Публикация этой серии исследовательских статей представляет собой перспективный обзор передовых работ, выполняемых в свете растущего понимания учеными генома дуба.