CRISPR-метод для поиска уязвимостей раковых клеток
Биологи из Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) разработали метод на основе технологии CRISPR, позволяющий комплексно идентифицировать перспективные мишени для противораковых препаратов. Результаты опубликованы в Nature Biotechnology.
Суть метода
Метод использует CRISPR для точного редактирования генов, кодирующих белковые домены с "карманами" (binding pockets). Эти структурные элементы на поверхности белков — потенциальные мишени для лекарств, которые могут связываться с ними, как ключ с замком.
Исследователи мутируют ДНК, чтобы изменить форму конкретного кармана, имитируя действие эффективного препарата. Если после такой модификации раковая клетка теряет способность выживать и размножаться, этот карман считается критической уязвимостью.
Доказательство принципа
В эксперименте на клетках острого миелоидного лейкоза (AML) метод проанализировал около 200 потенциальных мишеней. Он успешно подтвердил 6 уже известных и валидированных фармацевтической наукой целей, а также выявил 19 новых, ранее не распознанных уязвимостей.
Значение работы
- Практическая направленность: Лаборатория фокусируется на поиске "карманов", которые технически считаются "подходящими для создания лекарств (druggable)", чтобы предоставить фармкомпаниям мишени, против которых у них уже есть опыт разработки препаратов.
- Широкие перспективы: Метод предлагает способ комплексного выявления специфических уязвимостей раковых клеток для разных типов и подтипов рака.
- Цель: Создать полный каталог критических точек уязвимости в раковых клетках, лишив их того, в чём они нуждаются для выживания.