Бактериофаг crAssphage как индикатор загрязнения воды для орошения
Кросс-ассемблирующий фаг (crAssphage) — один из самых распространённых вирусов в пищеварительной системе человека. Его геном (~97 000 пар оснований) был случайно обнаружен в 2014 году (Nature Communications).
Это бактериофаг, заражающий бактерии, а не клетки человека, и потенциально полезный для здоровья. Поскольку crAssphage обитает исключительно в кишечнике человека, он может служить точным индикатором фекального загрязнения воды и пищи.
Исследователь из Университета Питтсбурга Кайл Бибби получил грант от Центра безопасности продукции (CPS) на изучение crAssphage как маркера загрязнения воды для орошения сельхозкультур.
Проблема: Качество воды сейчас контролируют по бактериальным показателям, но вирусы представляют наибольший риск для здоровья (например, Salmonella, Hepatitis A). Бактерии — плохие индикаторы наличия вирусов.
Решение: Метод «отслеживания микробного источника» (microbial source tracking). Обилие crAssphage в человеческих фекалиях делает его перспективным индикатором фекального загрязнения и сопутствующих патогенов.
План исследования «Developing Cross-Assembly Phage as a Viral Indicator for Irrigation Waters»:
- Отбор проб оросительной воды.
- Измерение уровней crAssphage, вирусов и других показателей.
- Установление корреляции между присутствием crAssphage и патогенов.
Цель: Доказать, что crAssphage — надёжный индикатор. Это может значительно повысить безопасность продукции и качество воды, приблизившись к цели закона «О чистой воде» — сделать все водоёмы США пригодными для рыбалки и купания.