Новый метод показывает изменения белков в интактных микробных сообществах

Новая методика позволяет анализировать посттрансляционные модификации (PTM) белков, собранных из интактного микробного сообщества (метапротеома). Это связывает PTM с атрибутами сообщества, которые можно легко идентифицировать, и помогает понять более широкие изменения биологических процессов в разных средах.

Суть метода

  • Технология: Использование высокоразрешающей масс-спектрометрии в сочетании с высокопроизводительными вычислениями.
  • Объект: Исследование PTM в модельном сообществе биоплёнки из высококислотной среды.
  • Результат: PTM-регуляция была связана с несколькими атрибутами сообщества, которые нельзя было объяснить наблюдаемыми изменениями в экспрессии генов.

Ключевые выводы

Связанные с PTM атрибуты сообщества включали изменения в:

Это значительный прогресс в применении подходов системной биологии для анализа на уровне сообществ. Команда работает над масштабированием метода для изучения более сложных сообществ и сред.