Бактерии Frankia — потенциальный источник ценных природных соединений

Бактерии рода Frankia, обитающие в почве, обладают потенциалом для производства множества природных соединений. Согласно исследованию в журнале Applied and Environmental Microbiology (июнь 2011 г.), к ним могут относиться антибиотики, гербициды, пигменты, противораковые агенты и другие полезные продукты.

Геномный анализ для этого исследования предоставил эксперт по Frankia, профессор микробиологии и генетики Университета Нью-Гэмпшира Луи Тиса.

Ключевые выводы исследования:

• Ученые во главе с Брэдли Муром из Скриппсовского океанографического института обнаружили в Frankia генетические структуры, сходные с теми, что отвечают за синтез различных ценных категорий природных продуктов. Эти категории производят большинство природных антибиотиков, используемых в качестве лекарств.
• Для анализа использовались передовые методы, позволившие выявить неожиданные соединения в этом организме.
• Frankia — это азотфиксирующие бактерии, живущие в симбиозе с актиноризными растениями (к которым относятся, например, буки и вишни). Ранее они не использовались, отчасти из-за сложности культивирования в лаборатории.
• Новые генетические методы позволяют переносить гены, кодирующие перспективные природные продукты, из Frankia в более удобные для выращивания бактерии-хозяева для производства.

Роль лаборатории Тиса:

Лаборатория Тиса, где с ним работал бывший аспирант, а ныне лаборант Николас Бошмен, предоставила биологические данные для геномного майнинга. Этот современный метод поиска генетических последовательностей был критически важен для результатов и, по словам Мура, является «дополнением к гораздо более трудоемкому традиционному открытию природных лекарственных средств, которое не менялось десятилетиями».