Студенческая исследовательская команда секвенировала геном бактерии, обнаруженной в саду Virginia Tech
Под руководством фитопатолога из Virginia Tech группа старшеклассников, студентов и аспирантов выделила и охарактеризовала ранее неизвестную группу бактерий.
Бактериальный штамм относится к виду фитопатогенов Pseudomonas syringae. Одна бактерия этой группы, штамм 642, была выделена в Саду Хана и стала первой бактерией, выделенной на кампусе Virginia Tech, чей геном был секвенирован.
Многие штаммы P. syringae, встречающиеся на самых разных растениях, вызывают болезни, такие как бактериальный ожог, пятнистость и рак. Однако штамм 642 P. syringae не вызывает болезней ни на одном из протестированных видов растений.
"Поскольку выделенная и секвенированная нами бактерия сама по себе не является патогенной, но очень похожа на патогены, мы можем сравнить её геном с геномами близкородственных патогенов и понять, какие механизмы используют бактерии для вызывания болезней и как они эволюционируют в патогены", — сказал Борис Винацер.
Генетический анализ этой уникальной группы бактерий P. syringae показал, что к ней же относится первая генетически модифицированная бактерия, выпущенная в окружающую среду в 1987 году. Исследователь Стив Линдоу удалил у неё ген, кодирующий белок, вызывающий замерзание воды при относительно высоких температурах, чтобы защитить растения от заморозков.
Также к этой же группе относится бактерия, выделенная исследователями из Cornell University в штате Нью-Йорк, которая подавляет гриб, вызывающий болезнь яблони.
Сейчас исследователи проверяют, может ли штамм 642 подавлять патоген, вызывающий разрушительную болезнь фасоли в Вирджинии. "Эта бактерия потенциально могла бы использоваться для защиты урожая от многих различных патогенов, но поиск оптимального способа её применения в поле — это сложная задача", — отметил Винацер.
В геноме бактерии также обнаружены гены, схожие с генами человеческого патогена, но известно, что она не может вызывать болезни у людей, поскольку перестаёт расти при 30 градусах Цельсия.