Разработка новых аптамеров открывает возможности для лечения рака и неврологических заболеваний

Исследователи из Городского университета Гонконга (CityU) создали новую платформу для отбора L-РНК аптамеров, способных нацеливаться на функциональные G-квадруплексы (G4) — особые структуры в ДНК и РНК, играющие ключевую роль в клетках и связанные с развитием рака и неврологических заболеваний.

Ключевое достижение

Учёные впервые идентифицировали L-РНК аптамер L-Apt12-6, который сильно и специфично связывается с параллельными G-квадруплексами, в отличие от других топологий G4 и нуклеиновых структур. Это первый L-РНК аптамер, способный в целом нацеливаться на ДНК G4, конкретно — на параллельную конформацию.

Значение открытия

• L-Apt12-6 может регулировать экспрессию гена протоонкогена c-kit1 в раковых клетках, демонстрируя потенциал для контроля G4-опосредованной генной активности in vitro и в клетках.
• Новый аптамер может быть доработан путём присоединения функциональных модулей (белков, пептидов, лигандов), что расширяет его применение в биомедицине и биотехнологиях.

Инновационная методика

Для преодоления неспецифического обогащения в процессе SELEX команда разработала высокопроизводительный метод отбора «G4-SELEX-Seq», сочетающий SELEX с высокопроизводительным секвенированием нового поколения (NGS) для всестороннего анализа обогащённой библиотеки. На отладку платформы ушло более года.

Перспективы

Новая стратегия SELEX может быть адаптирована и для других нуклеиновых структур. Полученные результаты открывают путь к разработке новых препаратов для лечения заболеваний, связанных с G-квадруплексами.

Исследование «Selective targeting of parallel G-quadruplex structure using L-RNA aptamer» опубликовано в журнале Nucleic Acids Research.