Первое сравнительное исследование анатомии дождевых червей с помощью 3D-микротомографии

Исследователи впервые применили метод неинвазивной 3D-визуализации — микро-компьютерную томографию (микроКТ) — для сравнительного изучения морфологии и анатомии дождевых червей. Работа опубликована в открытых журналах GigaScience и PLOS ONE.

Проблема и решение

• Проблема: Тысячи видов дождевых червей сложно различать. Многие виды инвазивны и угрожают экосистемам. Диссекция мелких мягкотелых организмов и работа с редкими музейными образцами затруднены.
• Решение: Метод микроКТ позволяет оцифровать структуры червей без разрушения образца и значительно быстрее. Исследователи смогли в 3D рассмотреть как внутренние органы в их взаимном расположении, так и содержимое кишечника (осадок).

Ключевые результаты

• Таксономически важные морфологические признаки теперь можно оценивать без диссекции.
• Метод применим как к свежим образцам, так и к историческим музейным экземплярам (проверено на образцах с 1945 года).
• Созданы высококачественные 3D-видео для виртуальной "диссекции".

Открытые данные и их значение

Авторы открыто опубликовали все исходные и производные данные в репозитории GigaDB.

• Это редкая практика для сообщества морфологов и таксономистов.
• Работа демонстрирует возможность обработки больших и сложных наборов данных (некоторые папки ~10 GB), используя высокоскоростное соединение Aspera в GigaDB.
• По словам рецензента, это "переводит таксономию в новую эпоху": вместо запроса физического образца из музея можно загрузить его точное цифровое представление.

Исследование открывает путь для высокопроизводительных исследований зоологических коллекций и интерактивного компьютерного изучения музейных образцов по всему миру.