Каталогизация 10 миллионов генов микробиома кишечника человека

Исследования кишечного микробиома подтвердили его ключевую роль для здоровья. Международный консорциум MetaHIT с участием INRA создал самую полную базу данных микробных генов, которая станет эталоном для всех исследований кишечных бактерий.

Микробиом кишечника, содержащий десятки триллионов бактерий, напрямую связан с иммунной системой и мозгом и играет важную роль в хронических заболеваниях, таких как ожирение и диабет 2-го типа. Однако исследования в этой области зависят от наличия референсных баз генов, которые ранее создавались на основе ограниченного числа образцов.

Исследователи консорциума MetaHIT объединили существующие каталоги (европейский, американский и китайский) и дополнили их новыми последовательностями. Получившийся каталог содержит почти 10 миллионов генов и представляет собой наиболее полную коллекцию микробных генов и их функций в глобальной популяции.

Большинство генов (около 6 миллионов) являются редкими и присутствуют лишь у 1% населения. Если данные о наиболее распространённых генах уже существуют, то будущие исследования будут сосредоточены на определении роли этих редких генов.

Этот каталог позволит описать наиболее клинически значимые гены, связанные с такими заболеваниями, как диабет 2-го типа, цирроз печени, сердечно-сосудистые заболевания и некоторые виды рака. Он также даст более полное представление о дисбалансе микробиома (дисбиозе), в том числе вызванном приёмом лекарств.