Современные жеребцы — близкие родственники: «Конный Адам» жил недавно

У млекопитающих пол определяется хромосомами: две X-хромосомы — самка, X и Y — самец. Y-хромосома передаётся только от отца к сыну, поэтому она представляет собой мужскую генеалогическую линию. В отличие от неё, митохондриальная ДНК (мтДНК) наследуется от матери всем потомкам. У современных лошадей мтДНК чрезвычайно разнообразна, что указывает на множество женских линий в прошлом.

Однако до недавнего времени на Y-хромосоме домашней лошади практически не обнаруживалось генетического разнообразия. Это создавало научный парадокс: как вид со многими женскими линиями может иметь так мало мужских?

Исследователи из Венского университета ветеринарной медицины (Vetmeduni Vienna) под руководством Барбары Валльнер решили эту проблему. Проанализировав 200 тыс. пар оснований (200 kb) Y-хромосомы у 17 лошадей разных европейских пород, они обнаружили крайне низкое разнообразие — всего пять вариабельных позиций (полиморфизмов).

Этих пяти полиморфизмов оказалось достаточно, чтобы построить «генеалогическое древо». Исследование более 600 жеребцов из 58 (в основном европейских) пород позволило выделить шесть основных линий (гаплотипов):

• Гаплотип 1 (предковый): Распространён почти во всех породах и регионах.
• Гаплотип 2: Также встречается часто, но отсутствует в североевропейских породах и на Иберийском полуострове.
• Гаплотип 3: Присутствует почти у всех чистокровных верховых (English Thoroughbred) и многих полукровных пород.
• Гаплотипы 4–6: Обнаружены только в локальных североевропейских породах: исландских лошадях, норвежских фьордах и шетлендских пони.

Сопоставление генетических данных с известными племенными книгами (ведущими историю с XVIII века) позволило проследить происхождение многих современных мужских линий. Например, распространение одного гаплотипа отражает активный завоз жеребцов с Ближнего Востока в Центральную и Западную Европу за последние 200 лет. Другой гаплотип возник в результате мутации у знаменитого жеребца «Эклипс» (Eclipse), его сына или внука. Почти все чистокровные верховые и около половины современных спортивных пород несут этот «гаплотип Эклипса».

Низкое разнообразие Y-хромосомы, резко контрастирующее с разнообразием мтДНК, объясняется высокой вариабельностью репродуктивного успеха самцов. У диких лошадей полигинная система размножения, а в домашнем коневодстве отдельные жеребцы-производители могут передавать свои гены целым поколениям.

«Большинство современных пород было создано за последние два столетия, — отмечает старший автор работы Готтфрид Брем. — За это время лошадь перешла из рабочего и военного статуса в сферу досуга и спорта. Это было достигнуто за счёт использования в разведении немногих отобранных самцов. Ограниченное генетическое разнообразие Y-хромосомы современной лошади — это отражение того, что пережило бурную историю вида».