Техника высокоплотного скрининга выявила ключевые гены для биотехнологических улучшений

Ученые из Национальной лаборатории Ок-Ридж и Университета Колорадо в Боулдере использовали инструмент подавления генов и большую библиотеку молекулярных гидов, чтобы понять, как фотосинтезирующие бактерии адаптируются к изменениям света и температуры. Они обнаружили, что даже частичное подавление определенных генов дает значительные преимущества в изменении реакции диких микробов на стресс. Исследование опубликовано в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

Эта мощная техника обеспечивает более быстрый и всесторонний способ влияния на свойства микробов для биотехнологий, предоставляя больше информации о функциях генов, чем традиционное редактирование генома, и ускоряя нашу способность улучшать микробы для производства топлива, химикатов и материалов, — сказала Кэрри Эккерт из ORNL.

Ученые применили по 10 сигнальных молекул, называемых guide RNA, к каждому гену в геноме цианобактерий, вместо типичных пяти или менее молекул; всего почти 33 000 guide RNA. Используя инструмент CRISPR interference, они идентифицировали гены, подавление которых привело к улучшению роста в сложных условиях. Исследователи применяют эту технику для оптимизации ранее идентифицированных микробов, используемых для производства биотоплива и биопродуктов.