Новый метод поиска биомаркеров может увеличить число диагностических тестов на рак

Исследователи, включая специалистов из UCSF, показали, что новый метод обнаружения и количественного определения белковых биомаркеров в жидкостях организма может позволить проверять множество биомаркеров в сотнях образцов пациентов. Это поможет отобрать для дальнейшей разработки только самые перспективные кандидаты.

Метод повышает точность выявления истинных биомаркеров рака и обладает высокой воспроизводимостью в разных лабораториях и на различных приборах, что важно для ранней диагностики.

Результаты исследования Clinical Proteomic Technology Assessment for Cancer (CPTAC), спонсируемого National Cancer Institute (NCI), опубликованы онлайн 28 июня 2009 года в журнале Nature Biotechnology.

Проблема: Ежедневно открываются тысячи потенциальных биомаркеров рака, но лишь единицы проходят клиническую валидацию. Ключевым ограничивающим фактором является отсутствие стандартизированных технологий и методик в процессе открытия и проверки биомаркеров.

Решение: В рамках многоинституционального исследования CPTAC было продемонстрировано, что две технологии — multiple reaction monitoring (MRM) в сочетании со stable isotope dilution mass spectrometry (SID-MS) — подходят для доклинических исследований.

Преимущества метода:

• Высокая чувствительность и специфичность для обнаружения реальных биомаркеров.
• Высокая воспроизводимость результатов между разными лабораториями и технологическими платформами при использовании общих образцов и стандартизированных протоколов.
• Позволяет быстро определить, обнаруживается ли кандидат в биомаркер в крови, и оценить, коррелируют ли его изменения с наличием или стадией заболевания.

Значение: Технология SID-MRM-MS может стать критически важным фильтром для оценки кандидатов в белковые биомаркеры, заполнив пробел в системном конвейере между открытием и клинической валидацией.

В исследовании участвовали пять институтов в рамках программы NCI Clinical Proteomic Technologies for Cancer (CPTC). Стандартизированные протоколы и общие образцы будут доступны через портал данных программы.