Новый и улучшенный анализатор томатов

Томаты представлены в разнообразии размеров и форм, что делает их идеальным объектом для тестирования ПО для анализа формы. Tomato Analyzer «быстро становится стандартом для морфологической характеристики плодов», согласно исследованию под руководством Марин Тэлбот Брюэр из Университета штата Огайо. Подробности последнего исследования команды опубликованы в Journal of the American Society for Horticultural Science.

Программное обеспечение, такое как Tomato Analyzer, помогает в морфологических исследованиях, предоставляя точные и объективные измерения формы плода. Анализ также более эффективен для большого числа объектов и может выявлять признаки, которые крайне сложно измерить вручную. Tomato Analyzer использует математические дескрипторы для количественной оценки различных характеристик формы на основе границы плода.

Морфометрия изучает количественный анализ формы и размера биологической формы с использованием положения и расстояния между ориентирами. Этот метод использовался для изучения вариаций, классификаций, эволюционного анализа, а также генетических исследований животных и насекомых. Морфометрический анализ менее субъективен и меньше зависит от ручных манипуляций, но его результаты — абстрактные величины. Результаты Tomato Analyzer более описательны, поскольку фактически измеряют углы или включают соотношения, которые лучше объясняют форму плода. Однако Tomato Analyzer предоставляет оба метода в одном приложении, позволяя исследователю выбрать вариант, наилучшим образом отвечающий потребностям проекта.

Основной целью исследования было изучение локусов количественных признаков (QTL) — частей генетического кода, контролирующих форму плода. Затем сравнивались QTL, определенные с помощью морфометрического и граничного анализа. В ПО Tomato Analyzer был добавлен новый набор измерений для расчета площади перикарпа, перегородки и плаценты. Эти внутренние сегменты плода помогают объяснить форму более полно, чем только внешний силуэт.

У томата сорта 'Sausage' два локуса были идентифицированы как контролирующие более 50% индекса внутренней формы, который придает томату удлиненную или «грушевидную» форму. Визуальное наблюдение подтвердило, что ПО точно измерило степень грушевидности. Дополнительные тесты для определения угла проксимального конца (формы плода у стебля) показали сопоставимые результаты между двумя методами. Это увеличивает универсальность измерений ПО для исследователей.

QTL, обнаруженные у сортов 'Sausage' и 'Rio Grande', значительно перекрывались. Хотя большинство, если не все, QTL, контролирующие форму и размер плода, были идентифицированы с помощью приложений Tomato Analyzer, морфометрические анализы — эффективный способ исследования различных размеров и форм плодов. Поскольку оба типа анализа доступны в Tomato Analyzer, ПО позволяет исследователям быстро отмечать морфологические вариации с помощью функции морфометрии, а затем углубляться в детали с помощью функции атрибутов.