Исследователи используют TurboID для обнаружения новых мейотических белков в Arabidopsis thaliana

Мейотическая рекомбинация обеспечивает генетическое разнообразие при скрещивании. Во время профазы I мейоза хромосомы организованы в петлеобразный массив белковой структурой, называемой мейотической осью хромосомы, которая критически важна для рекомбинации и генетически разнообразных гамет. Международная исследовательская группа под руководством Института IPK Лейбница сообщает об использовании подхода на основе TurboID для идентификации белков вблизи мейотических осей хромосом у Arabidopsis thaliana. Были обнаружены как известные, так и новые мейотические белки. Результаты опубликованы в журнале Nature Plants.

В A. thaliana белки, ассоциированные с осью, ASY1 и ASY3 критически важны для синапсиса и мейотической рекомбинации. Однако протеомные исследования растений, направленные на изучение состава и регуляции мейотических процессов, включая оси хромосом, затруднены из-за ограниченного числа мейотических клеток, встроенных в цветочные органы.

Более новая технология proximity-dependent biotin identification (BioID) позволила идентифицировать ближайшие белковые интерактомы. BioID основана на слиянии белка-мишени с промисскуозной биотинилигазой, которая катализирует биотинилирование белков в непосредственной близости.

«Мы применяем улучшенную версию BioID, названную TurboID, для proximity labeling мейотической оси хромосом. Мы слили TurboID с белками оси ASY1 и ASY3, чтобы идентифицировать их ближайшие интерактомы в A. thaliana», — говорит доктор Штефан Хекманн. Было идентифицировано 39 кандидатов, находящихся вблизи ASY1 и/или ASY3. Помимо известных белков, связанных с мейотической осью хромосом, были также обнаружены новые белки, играющие роль во время мейоза.

«Успешное применение TurboID в мейотических клетках предполагает, что использованный метод может быть широко применим для редких типов клеток», — говорит доктор Чао Фэн, первый автор исследования.