Различие между смертоносными и безвредными штаммами стафилококка
Бактерии Staphylococcus aureus — основная причина кожных, мягкотканных и других инфекций. Угрозу общественному здоровью усугубляет рост устойчивых к антибиотикам штаммов, включая MRSA. При этом стафилококк часто безвредно колонизирует носовые ходы человека.
Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего изучили не один геном, а пан-геном — совокупность геномов 64 различных штаммов, различающихся средой обитания, типом хозяина и устойчивостью к антибиотикам. Работа опубликована 6 июня в Proceedings of the National Academy of Sciences.
Ключевые результаты:
- Пан-геном 64 штаммов содержит 7 457 генов.
- Ядерный геном (гены, необходимые для жизни, есть у всех штаммов) составляет 19% (1 441 ген).
- Диспенсабельный (необязательный) геном — 81%:
- Аксессорные гены (есть у некоторых штаммов) — 39% (2 871 ген).
- Уникальные гены (есть только у одного штамма) — 42% (2 871 ген).
Диспенсабельные гены дают штаммам преимущества в специфических условиях: адаптация к разным средам, колонизация новых хозяев, устойчивость к антибиотикам.
Значение исследования:
- Системный подход: Использование компьютерного моделирования метаболизма позволило проанализировать способность 64 штаммов выживать в более чем 300 различных средах.
- Дорожная карта: Работа определяет, что значит быть Staphylococcus aureus, и позволяет целенаправленно искать новые терапевтические мишени.
- Основа для новых исследований: Полученные данные будут использованы в рамках нового междисциплинарного центра по изучению биологии устойчивости к антибиотикам, поддержанного грантом NIH в $9.5 млн на 5 лет.