От Шерборна до ZooBank: Переход к взаимосвязанной цифровой номенклатуре будущего

Таксономия и научные названия — это две отдельные, но взаимозависимые системы. Номенклатура — это бюрократический свод правил, привязанный к опубликованным записям и типовым образцам. Она создает жесткий каркас для знаний. Таксономия же — это наука, основанная на данных и интерпретации, чьи концепции открыты для проверки и изменений.

Основателем биоразнообразия в информатике является Чарльз Дэвис Шерборн. Его главный труд, Index Animalium, заложил библиографическую основу для современной зоологической номенклатуры. Над этим ресурсом он работал 43 года, закрепив наше понимание разнообразия животных через опубликованные научные записи. Этот труд до сих пор активно используется.

Специальный выпуск журнала ZooKeys посвящен Шерборну, его вкладу и будущему биоразнообразия в информатике. Статьи выпуска охватывают три области: историю, текущую практику и перспективы.

В конце 1880-х годов Шерборн осознал необходимость полного указателя названий к их первоисточникам. Он начал создавать полный индекс для названий животных (которые составляют 1.4 миллиона из 1.8 миллионов описанных видов). Эта работа повлияла на кодификацию самих номенклатурных правил.

Index Animalium включает более 9000 страниц в 11 томах и около 440 000 названий. Уровень ошибок в нем поразительно низок, и он остается наиболее полным справочным источником по номенклатуре животных. Будущее биоразнообразия в информатике строится на работе Шерборна, расширяясь в цифровую, диверсифицированную и доступную сферу.

Издатель этого тома, журнал ZooKeys, сам является пионером в разработке более стабильной и доступной научной номенклатуры. Вместе с PhytoKeys он тестирует инновационный рабочий процесс с автоматизированной регистрацией номенклатурных актов до публикации. Эта инициатива реализуется в рамках проекта EU FP7 pro-iBiosphere в сотрудничестве с ZooBank (официальный онлайн-реестр научных названий животных), Zoological Record, IPNI, MycoBank, Index Fungorum и проектом Global Names.

Шерборн был человеком, который с уважением относился к прошлому, но видел будущее. Он оценил бы новые инструменты для амбициозной цели — связать всю биологическую информацию через названия, читаемые как машинами, так и людьми.