Новый инструмент ScIsoX раскрывает скрытую сложность генов

Ученые из Университета Джеймса Кука создали новый компьютерный инструмент, который выявляет ранее невидимые уровни активности генов, открывая новые возможности для понимания здоровья и болезней.

Инструмент под названием ScIsoX анализирует крошечные вариации в том, как гены считываются внутри отдельных клеток — так называемые изоформы. Эти изоформы могут менять поведение клетки, но большинство существующих методов их игнорируют.

«Гены — это как песни, а изоформы — разные ремиксы, — сказал Таддеус Ву, ведущий автор работы, опубликованной в журнале Genome Biology. — ScIsoX позволяет нам услышать весь плейлист, а не только главный трек».

Анализируя отдельные клетки из реальных наборов данных, ScIsoX выявил паттерны активности генов, которые могут помочь исследователям лучше понять такие состояния, как рак, неврологические расстройства и иммунные заболевания.

Программное обеспечение бесплатно доступно для ученых по всему миру на GitHub.