Дикие и содержащиеся в неволе пятнистые дельфины имеют разную микробиоту кишечника

Исследование, опубликованное в журнале Water Biology and Security, показало, что различия в источниках пищи играют ключевую роль в формировании микробиома кишечника пятнистых дельфинов, даже если они обитают в сходных условиях.

На состав и структуру кишечных микробов влияют филогения, среда обитания и диета, но главный фактор оставался неясным. В новой работе учёные изучили влияние именно вариаций в питании, сравнив диких дельфинов, питающихся естественной добычей, и дельфинов, содержащихся под опекой человека на ограниченном рыбном рационе. При этом факторы среды были контролированы в рамках одной географической популяции.

• Метод: Для классификации кишечных микробов использовали V4-регион гена 16S рРНК.
• Результаты: Обнаружены значимые различия в структуре микробного сообщества желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) между дикими и содержащимися в неволе дельфинами как в целом, так и на конкретных участках ЖКТ.
• Ключевой вывод: При этом микробное разнообразие в ЖКТ существенно не различалось, что указывает на то, что различия обусловлены в первую очередь составом микробиоты, а не её разнообразием.

Были определены индикаторные микробы для каждой группы: пять вариантов последовательностей ампликонов (ASVs) для диких дельфинов и три — для содержащихся под опекой человека. Также было выявлено множество потенциально патогенных бактерий.

Исследование углубляет понимание микробиологии кишечника пятнистых дельфинов и проливает свет на сходства и различия в микробных сообществах ЖКТ внутри одного вида морских млекопитающих, когда вариации источников пищи играют в их экологии значительную роль.