Создан новый метод пространственной омики

Исследователи из Университета Уппсалы, Стокгольмского университета и Королевского технологического института KTH создали новый метод пространственной омики. Они объединили две сложные техники, обычно используемые по отдельности — визуализацию масс-спектрометрии (MSI) и пространственно разрешённую транскриптомику (SRT), — сделав важный шаг в исследовании биологических тканей. Исследование опубликовано в журнале Nature Biotechnology.

«Наш метод позволяет визуализировать как низкомолекулярные метаболиты, например сигнальные молекулы в мозге, так и РНК-транскрипты — в одном и том же срезе биологической ткани — без ущерба для качества или точности результатов. Эти открытия могут значительно продвинуть область пространственной биологии и патологических исследований», — говорит Пер Андрен, профессор визуализации масс-спектрометрии в Университете Уппсалы и SciLifeLab.

Метод, успешно продемонстрированный на срезах тканей мозга мышей и человека, был нацелен на изучение сигнальных молекул и их роли в болезни Паркинсона. Анализируя сложные молекулярные профили в одном срезе ткани, исследователи могут получить более глубокое понимание болезни Паркинсона и других сложных заболеваний.

Важный аспект метода — его способность визуализировать молекулы и их распределение в ткани, одновременно анализируя активность генов. Эта методология позволяет исследовать связь между экспрессией генов и молекулярной активностью на новом уровне.

«Метод применим не только в нейробиологии и потенциально может изменить ландшафт в различных областях биологических и медицинских исследований, например, в онкологии. Изучая микроокружение опухоли и реакцию на лечение на молекулярном уровне, метод может стать ключом к пониманию сложных заболеваний и оптимизации терапевтических стратегий», — отмечает Андрен.