Исследователи приоткрыли завесу над упрямым пробиотиком

Новое исследование Университета Северной Каролины показывает прогресс в сборе информации о важной, но трудно поддающейся характеристике кишечной бактерии человека — Bifidobacterium, которая используется во многих пробиотиках для поддержания здорового микробиома. Результаты открывают перспективы для улучшения так называемых "хороших бактерий".

Bifidobacterium — один из двух основных игроков в пробиотической индустрии наряду с Lactobacillus и особенно доминирует в толстой кишке младенцев. Однако с ней гораздо сложнее работать.

Исследователи использовали как собственную CRISPR-Cas систему бактерии, так и портативный инженерный CRISPR эффектор. Оказалось, что у Bifidobacterium изобилие собственных CRISPR-Cas систем, включая относительно малоизученную систему типа I-G.

В отдельных экспериментах учёные с помощью этой внутренней системы и портативного цитозинового базового редактора восстановили чувствительность штамма Bifidobacterium к распространённому антибиотику — тетрациклину. Восстановление антибиотикочувствительности важно, поскольку бактерии потенциально могут передавать устойчивость другим бактериям в кишечнике.

Исследователи также обнаружили крошечные изменения в разных штаммах бактерии — SNP (однонуклеотидные полиморфизмы), которые, по-видимому, отражают большие различия в фенотипах (характеристиках) штаммов. Разница в одной "букве" генетического кода у штаммов, сходных более чем на 99%, может приводить к огромным различиям.