Новое поколение каталога культивируемых бананов
Исследователи представили передовой каталог разнообразия бананов, используя инновационные геномные методы для отслеживания происхождения различных сортов. Исследование, опубликованное в журнале Plants, People, Planet, стало результатом сотрудничества нескольких институтов.
Новый метод: картирование хромосом in silico
Достижения в понимании генома культивируемого банана позволили разработать метод in silico chromosome painting. Этот компьютерный метод определяет происхождение хромосом в сортах банана. Технику применили к множеству образцов из международного генбанка, а также к новым материалам из Юго-Восточной Азии и Тихоокеанского региона.
Результат: геномные "мозаики"
Результатом стала серия цветных, похожих на мозаику изображений хромосом, которые можно считать геномными сигнатурами различных групп сортов, таких как известный Кавендиш или плантен. Исследование также показало, что некоторые локально ценные группы, например, Pisang Awak или Maia Maoli Popoulu, не являются единым клоном, что открывает новые перспективы для изучения разнообразия культуры, часто выращиваемой моноклонально.
Коллективный труд и будущее
Альберто Ченчи, соавтор исследования, подчеркивает: "Это результат тщательной обработки автоматических анализов и бесчисленных часов коллективных усилий". Его коллега Катрин Бретон отмечает потенциал искусственного интеллекта для ускорения процесса.
Джули Сардос, эксперт по разнообразию бананов, уверена, что будущие миссии в Азии и Океании — центре происхождения бананов — принесут новые открытия. Отдельное исследование в континентальной Юго-Восточной Азии уже выявило скрытое разнообразие у диких бананов.
Значение каталога
Матьё Руар, ведущий учёный проекта, заявил: "Нам потребовалось несколько лет, чтобы доработать концепцию этого каталога... Результаты могут иметь значение для сельскохозяйственных систем, селекции и улучшения сохранения в международных генбанках".
Каталог будет обновляться по мере новых открытий и доступен как в печатном виде, так и в качестве онлайн-инструмента.
