Нанотранспортное секвенирование может резко снизить стоимость анализа ДНК

Исследователи из Oxford Nanopore Technologies (Великобритания) успешно протестировали систему, которая идентифицирует нуклеотидные основания ДНК напрямую, пока молекула проходит через модифицированный белковый нанопор.

Принцип работы

• В отличие от большинства современных секвенаторов, использующих флуоресцентные метки, камеры и сложное ПО, эта система пропускает ДНК по одному «букве» (нуклеотиду) через микроскопическое отверстие.
• Электрический ток, проходящий через пору, по-разному реагирует на каждое из четырёх оснований генетического кода (A, T, G, C), что позволяет считывать последовательность.

Значение и перспективы

• По словам генерального директора Oxford Гордона Сангеры, технология может значительно сократить дорогостоящее оборудование, реактивы и лабораторное время: «Вы переходите от дней к часам для получения той же информации, и требуемое оборудование намного проще».
• Джеффри Шлосс, директор программы технологий секвенирования Национального исследовательского института генома человека, назвал возможность различать четыре основания с помощью чисто электронного сигнала «невероятным достижением».
• Технология рассматривается как потенциальный кандидат для достижения цели — секвенирования генома за $1000 к 2014 году (сейчас стоимость около $100 000). Однако на данный момент компания научилась считывать только отдельные нуклеотиды и работает над усовершенствованием системы для сканирования целых цепочек ДНК.

Исследование опубликовано в журнале Nature Nanotechnology в статье «Continuous base identification for single-molecule nanopore DNA sequencing».