Учёные обнаружили универсальную молекулярную «метку» для ключевых генов

Исследователи из Стэнфордского университета, проанализировав более 200 генетических наборов данных, идентифицировали молекулярную метку, которая отмечает гены, критически важные для функции клетки.

Эта метка, по-видимому, существует универсально — в клетках от червей до человека — и может использоваться для расшифровки функции незнакомых клеток. Например, изучая набор помеченных генов, можно классифицировать клетку как мышечную, кожную или другого типа.

Метка представляет собой длинную молекулу, обозначаемую как H3K4me3, которая присоединяется к гистонам — белкам, связанным с ДНК. Она обычно отмечает около 1000 генов в каждой клетке, но набор помеченных генов варьируется в зависимости от типа клетки.

Молекула H3K4me3 не заставляет клетку производить больше белков, кодируемых помеченными генами. Вместо этого, как полагают учёные, она регулирует частоту транскрипции ДНК, обеспечивая стабильное, «как часы», производство критических белков, а не всплески активности с последующими паузами.

Исследователи создали новую базу данных bddb.stanford.edu, где можно изучить связь этой метки с генами в различных клетках. В качестве примера они картировали помеченные гены в нейральных стволовых клетках мыши. Метка идентифицировала как уже известные ключевые гены, так и несколько менее изученных.

В будущем команда планирует изучить роль этой молекулярной метки в поддержании идентичности клетки при изменениях окружающей среды, а также её роль в процессе старения.