Микробиом метро Гонконга смешивается к вечернему часу пик

Ежедневно стокилометровая система метро Гонконга перевозит почти пять миллионов пассажиров. Исследователи, опубликовавшие работу 31 июля в журнале Cell Reports, показали, как микробы от этих людей смешиваются в течение дня. Утром каждая линия метро имеет характерный набор бактерий, но к вечеру эти уникальные сообщества объединяются в единый однородный микробиом по всей системе.

«Утром каждая линия имеет уникальные микробные особенности, отражающие районы, через которые она проходит. Но с увеличением пассажиропотока в течение дня микробные сообщества всех линий становятся более похожими, в них доминируют комменсальные бактерии кожи человека», — говорит Джанни Панайотоу, системный биолог из Института Ганса Кнёля (Германия) и Университета Гонконга.

Исследователи хотели выяснить, как географические особенности линий и их связь с улицами влияют на микробный состав, и меняется ли он в зависимости от времени суток из-за пассажиропотока.

Метод исследования

Чтобы смоделировать опыт среднего пассажира, добровольцы ездили в метро по полчаса в утренний и вечерний часы пик. После каждой поездки у них брали пробы с кожи рук. Учёных интересовали не бактерии на поверхностях вагонов (как в более ранних исследованиях в Бостоне и Нью-Йорке), а те, что передаются на руки пассажиров.

Результаты

Большинство перенесённых микробов были относительно безвредными комменсалами кожи. Однако были обнаружены и некоторые патогены. Лучшей иллюстрацией модели смешивания стали гены антибиотикорезистентности (ARGs). «Утром ARGs были обнаружены только на нескольких линиях, но к вечеру их можно было отследить на всех», — отмечает Панайотоу.

Выводы

«Идея этого проекта не в том, чтобы напугать людей, потому что мы наблюдали, что более загруженные линии метро не несут более высоких рисков для здоровья — ни с точки зрения патогенов, ни с точки зрения генов устойчивости к антибиотикам», — подчёркивает учёный. Цель — понять, как городское планирование влияет на типы бактерий, с которыми мы сталкиваемся, чтобы подобные исследования могли в будущем направлять стратегии общественного здравоохранения и проектирование общественного транспорта.