Библиотека мембранных белков открывает новую границу в изучении клеточного пространства-времени

Ученые исследуют новую границу в биологии — пространственно-временное окружение наших клеток — в поисках решений таких заболеваний, как рак.

Более 60% современных рыночных препаратов нацелены на мембранные белки. Этот показатель может вырасти благодаря новой доступной молекулярной «библиотеке», разработанной в Йельском университете под руководством ассистент-профессора клеточной биологии Каллола Гупты.

«Если мы хотим понять, что делает белок, как на него влияет окружение и как именно он запускает развитие болезни, нам нужно понимать, что его окружает», — объяснил Гупта.

Исследователи создали новую платформу, которая предоставляет доступ примерно к 2000 мембранных белков, а также химический инструмент для изучения областей, окружающих белки-мишени.

«Мы хотели поделиться этими важными инструментами для изучения мембранных белков и сделать их доступными для исследователей по всему миру», — сказала аспирант лаборатории Гупты и соавтор исследования Кэролайн Браун. Работа опубликована в Nature Methods.

Ожидается, что новая база данных сэкономит время исследователям, пытающимся найти белки, связанные с конкретной проблемой здоровья.

Ученые также разработали новый инструмент для анализа более широкого клеточного пространства. Обычно измерения проводятся на микронном уровне, но для понимания событий, управляющих сигнализацией белков, потребовалось разрешение в тысячу раз выше.

«Модулируя химию молекул, мы смогли изменить диаметр области интереса, чтобы создать новое пространственное разрешение», — пояснил Гупта.

Результатом стал программируемый химический «ковш» для сбора молекулярной информации из заданной наноразмерной области.

Этот технологический прорыв должен помочь большему числу ученых понять, как мембранные белки взаимодействуют друг с другом, что, в свою очередь, откроет новые мишени для лекарств, нарушающих пространственные сигналы, которые вызывают различные заболевания.