Учёные создали глобальный репозиторий для клеточной инженерии

Международная команда под руководством Университета Ньюкасла представила CellRepo — базу данных видов и штаммов, которая использует клеточные штрих-коды для мониторинга и отслеживания генетически модифицированных микроорганизмов.

Как это работает

• Система, описанная в Nature Communications, отслеживает и организует цифровые данные, полученные в процессе клеточной инженерии.
• Она молекулярно связывает эти данные с соответствующими живыми образцами, создавая их «цифровой отпечаток».
• В основе CellRepo лежит контроль версий — концепция из разработки ПО, которая записывает и отслеживает изменения в коде.

Ключевые преимущества

• Безопасность: Позволяет быстрее отследить происхождение и дизайн микроорганизмов в случае их случайного или преднамеренного высвобождения.
• Открытость и воспроизводимость: Делает инженерную биологию более открытой, воспроизводимой и заслуживающей доверия.
• Трассируемость: Предоставляет точную документацию по штамму и правильно учитывает авторство лабораторной работы.
• Коллаборация: Глобальная доступность ресурса поддерживает международное сотрудничество.
• Прозрачность и экономия: Повышает прозрачность исследований и снижает затраты, связанные с потерей данных и исходного кода.

Мнение экспертов

• Профессор Наталио Красногор, ведущий автор: «Инженерная биология — это не ракетостроение. Это гораздо, гораздо сложнее... CellRepo, по своей сути, — это платформа для сотрудничества».
• Доктор Джонатан Теллечеа, синтетический биолог: «CellRepo решает важные проблемы экспериментаторов, такие как ошибочная идентификация материалов и сложности с отслеживанием их происхождения».
• Профессор Виктор де Лоренцо, соавтор: «CellRepo предлагает стабильную и однозначную идентификацию данных штаммов, которые могут быть строго отслежены».
• Профессор Саймон Вудс, биоэтик: «Широкое внедрение CellRepo внесёт важный вклад в культуру науки, обеспечивая механизм трассируемости, прозрачности и воспроизводимости».

Учёные приглашают специалистов в области инженерной биологии, синтетической биологии и биотехнологий опробовать этот общедоступный ресурс.