Исследование подтверждает китайское происхождение вспышки PSA в Новой Зеландии

Ученые Университета Отаго представили убедительные доказательства того, что штаммы бактерии PSA (Pseudomonas syringae pv. actinidiae), вызвавшие вспышку в садах Северного острова Новой Зеландии, попали напрямую из Китая. Туда же ведет происхождение штаммов, ответственных за вспышки 2008 года в Италии и 2010 года в Чили. Это проясняет путь проникновения PSA в Новую Зеландию.

Исследование, основанное на детективной работе с ДНК с использованием технологий геномики, опубликовано в международном журнале PLOS ONE.

Методология и ключевые выводы

Для анализа географического происхождения ученые полностью секвенировали и сравнили геномы штаммов PSA из Японии, Чили, Китая, Италии и Новой Зеландии, также используя данные из публичных баз.

  • Общий предок: Было установлено, что основные геномы китайских, чилийских, итальянских и новозеландских штаммов практически идентичны и, вероятно, имели общего предка 10-15 лет назад.
  • Разные клоны: При этом новозеландские штаммы образуют отдельный клон, а итальянские — другой географический клон.
  • Происхождение: Результаты указывают на независимое китайское происхождение как итальянской, так и новозеландской вспышек, а также предполагают китайское происхождение чилийских штаммов.

Роль мобильных генетических элементов

Особое внимание ученые уделили обнаруженным в геноме PSA мобильным генетическим элементам — ICE (integrative conjugative elements). Они могут передаваться между клетками разных бактериальных штаммов, изменяя их свойства, например, заразность или устойчивость к антибиотикам.

Было идентифицировано три различных типа ICE:

  1. Общий для новозеландских штаммов и трех штаммов из Китая.
  2. Общий для итальянских штаммов и одного китайского штамма.
  3. Обнаруженный в чилийских штаммах.

Последствия для сельского хозяйства

По словам доцента Рассела Полтера, некоторые штаммы PSA могут быть более вирулентными из-за конкретного типа ICE, который они несут. Это имеет тревожные последствия: сорта киви, устойчивые к одному типу PSA, могут быть уязвимы для другого. Это подчеркивает критическую важность строгого пограничного контроля для стран-производителей киви.