Израильская компания по сжатию геномных данных решает проблему хранения информации
Проблема масштаба: Расшифровка индивидуальных геномов создаёт огромные объёмы данных — от 200 до 300 ГБ сырых данных на геном и до 1 ТБ после анализа. По словам генерального директора Geneformics Рафаэля Фейтельберга, это "один из главных сдерживающих факторов для повсеместного распространения геномики".
Решение: Израильская компания Geneformics, основанная в 2014 году на базе Института Вейцмана, разрабатывает инструменты и инфраструктуру для сжатия геномных данных. Их цель — сделать данные доступными.
Ключевые принципы технологии:
- Без потерь (lossless): После распаковки данные бит в бит соответствуют оригинальному, несжатому файлу.
- Высокая скорость: Система способна быстро декомпрессировать и передавать данные приложениям.
- Эффективность: Сжатие позволяет уменьшить объём данных до 90%, а интеллектуальное распределение хранения может увеличить эту экономию.
Клиенты и статус: Среди клиентов Geneformics — крупные организации: компания по секвенированию WuXi NextCode (США) и Институт медицинских исследований Гарван в Сиднее, обладающий одним из крупнейших в мире наборов геномных данных.
Технология и будущее: Принцип работы является коммерческой тайной. Как отмечает технический директор Арик Кешет, в молодой индустрии геномики пока нет стандартов сжатия, подобных JPEG или MPEG. Компания намерена использовать свои технологии и интеллектуальную собственность, чтобы влиять на формирование будущих стандартов.
Финансирование: Компания привлекла около $2.85 млн от инвесторов, включая председателя совета директоров Дова Морана (создателя DiskOnKey), и недавно выпустила своё первое облачное решение Geneformics D.