Экологи создали крупнейшую базу данных о почвенных грибах

Эколог Джастин Карст стала соавтором нового значимого ресурса — крупнейшей в мире базы данных исследований, анализирующих влияние микоризных грибов на продуктивность растений.

Это важное событие не только для её области, поскольку база данных публикуется в открытом доступе и доступна для всех, включая учёных по всему миру.

«Существует тенденция к тому, чтобы делать данные более доступными для других исследователей и общественности, — сказала Карст. — Обмен данными на открытых платформах способствует их повторному использованию, переосмыслению и проверке качества. Данные становятся общедоступными. Публикуя данные в таких журналах, как Scientific Data, те, кто ими делится, также получают за это признание».

Ранее нормой было собирать и хранить данные в лабораториях, публикуя лишь их сводку. Чтобы получить доступ к исходным данным, другим учёным приходилось индивидуально договариваться с автором, что было трудоёмко и оставляло много данных неиспользованными.

В лесной экологии доступ к данным о реакции растений на микоризные грибы (полезные грибы, живущие на корнях деревьев) особенно важен. Это одно из самых распространённых и древних симбиотических взаимодействий на Земле: грибы поставляют питательные вещества и воду в обмен на сахара растений. Однако о влиянии этих отношений на функционирование экосистем известно мало.

Новая база данных, MycoDB, проливает на это свет, хотя она охватывает лишь 351 вид растений из существующих 450 000. Она включает данные 4 010 экспериментов из 438 рецензируемых статей, показывающие, как различные виды растений ведут себя при инокуляции грибами по сравнению с контролем. Эти данные теперь доступны для будущих исследований, например, для метаанализа.

«Это фактически увеличивает размер выборки», — отметила Карст.

Кроме того, база содержит филогенетические данные («родословные»), показывающие эволюционные связи между растениями и между грибами. Это поможет исследователям количественно оценить экологические факторы, влияющие на результат инокуляции растений микоризными грибами.

Помимо применения в проектах восстановления и охраны природы, а также в обучении студентов, данные имеют и другую ценность: они позволяют искать общие закономерности в функционировании симбиотических организмов в целом.

База данных MycoDB доступна в Dryad Digital Repository. На её создание, представляющее 10 лет наиболее релевантных исследований, потребовались усилия 80 соавторов.