Новый геномный инструмент для исследователей ржавчины пшеницы

Запущен новый геномный инструмент для помощи мировому сообществу исследователей ржавчины пшеницы.

Rust Expression Browser — первый браузер экспрессии генов, позволяющий одновременно анализировать данные по экспрессии генов для опасного патогена желтой ржавчины и растения-хозяина — пшеницы. Он был разработан исследователями из John Innes Centre.

Новый веб-интерфейс в настоящее время содержит 1024 набора данных по экспрессии генов в удобном формате «укажи и щелкни». Это улучшает доступ к этим ценным, но сложным ресурсам данных. В частности, он содержит сотни наборов данных, полученных с использованием революционной геномной техники «field pathogenomics», разработанной в лаборатории Сондерс.

Гриб желтой ржавчины наносит огромный ущерб производству пшеницы во всем мире и является серьезным ограничивающим фактором для ее производства в Великобритании.

В новой статье, опубликованной в BMC Genomics, исследователи описывают создание этого инструмента и демонстрируют его полезность для ускорения исследований желтой ржавчины пшеницы.

Доктор Томас Адамс, первый автор статьи: «Мы рады поделиться с широким сообществом огромным объемом данных, собранных лабораторией за годы. Мы надеемся, что это сделает эти наборы данных более доступными для всех исследователей, независимо от доступа к специализированным компьютерным системам или опыта работы с данными секвенирования».

Доктор Диана Сондерс, автор-корреспондент: «Rust Expression Browser — фантастический ресурс для мирового сообщества исследователей ржавчины. Это, несомненно, приведет к новым захватывающим открытиям в понимании тонкостей взаимодействия желтой ржавчины и пшеницы-хозяина».