Расшифрован геном японской ипомеи

Исследователи из Японии успешно расшифровали полный геном японской ипомеи (Ipomoea nil). Эти традиционные садовые растения популярны в Японии, а их мутанты часто появляются из-за активности "прыгающих генов" — транспозонов. Начиная с периода Эдо (около 200 лет назад), ипомеи со странной формой цветов и листьев культивировались и ценились, что сформировало уникальную садовую культуру. Благодаря популярности этих "мутантных ипомей" было собрано множество природных мутантов. Их детальный анализ позволил учёным обнаружить ряд генов, определяющих форму цветов и листьев, а также окраску и узоры цветков.

Исследовательская группа расшифровала геном стандартной линии японской ипомеи. Профессор Кейо Ясубуми Сакакибара, руководивший сборкой и биоинформатическим анализом генома, заявил: "Была получена высококачественная, почти полная последовательность генома, что привело к идентификации кодирующих последовательностей примерно сорока трёх тысяч генов ипомеи, а также к определению количества и распределения транспозонов, которые создают потрясающее разнообразие её цветов и форм".

Используя полную последовательность генома, группа охарактеризовала мутантов, демонстрирующих карликовость с тёмно-зелёными, толстыми и морщинистыми листьями. Учёные идентифицировали ген биосинтеза растительного гормона, который нарушается транспозонами у этих мутантов.

Лектор Университета Кюсю Эйдзи Нитасака, куратор коллекции Национального проекта биоресурсов (NBRP) по ипомее, отметил: "С расшифровкой генома ценность использования японской ипомеи в качестве модельного организма резко возросла. Я надеюсь, что японские ипомеи и их мутанты будут использоваться многими исследователями по всему миру". Доцент Национального института фундаментальной биологии Ацуси Хосино, один из руководителей исследования, добавил: "Последовательность генома японской ипомеи не только поможет в её изучении, но также будет использована в исследованиях родственных сельскохозяйственных культур, таких как батат".

Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.