Первые генетические ключи к борьбе с усыханием ясеня

Учёные, изучающие усыхание ясеня, получили первые генетические подсказки, которые могут помочь в выявлении и селекции деревьев, устойчивых к болезни.

Исследователи из Йоркского университета проанализировали данные, полученные Центром Джона Иннеса и Центром анализа генома в Норидже, примерно от 180 датских деревьев. Восприимчивость этих деревьев к болезни была измерена учёными Копенгагенского университета.

"Некоторые датские деревья известны своей устойчивостью к болезни, и у нас появились первые данные, показывающие, что активность некоторых генов, по-видимому, особенно важна для этого", — заявил профессор Ян Бэнкрофт из Йоркского университета.

Одним из наиболее устойчивых датских деревьев является штамм "Дерево 35". Используя данные Центра анализа генома, доктор Мартин Трик из Центра Джона Иннеса составил каталог всех генов, экспрессируемых в этом штамме во время первого прироста молодых листьев. Затем он использовал его в качестве референса для каталогизации генетических вариаций среди 180 датских деревьев, оцененных на устойчивость к болезни.

Он также каталогизировал вариации в уровне экспрессии генов. Согласно анализу учёных из Йорка, эти данные оказались важными, поскольку активность некоторых генов, по-видимому, коррелирует с восприимчивостью или устойчивостью.

"Из глобального поиска по всем тысячам генов мы теперь можем сосредоточить наши исследовательские усилия примерно на дюжине, которые кажутся особенно важными", — сказал доктор Трик.

"Скорость, с которой сужается наш фокус, обусловлена совместным характером исследований."

Консорциум учёных под руководством Центра Джона Иннеса применяет генетические подходы из наук о растениях для реагирования на угрозу эпидемий болезней деревьев. Полученные в ходе исследования идеи и инструменты помогут в борьбе с будущими угрозами. Все результаты доступны на открытом сайте oadb.tsl.ac.uk, с помощью которого учёные привлекают к анализу специалистов со всего мира.

"Сейчас мы находимся на этапе, когда можем утверждать, что если определённые гены в конкретном дереве экспрессируются на определённом уровне, то это дерево, вероятно, будет менее восприимчиво к усыханию ясеня", — сказал профессор Бэнкрофт.

"Мы ожидаем, что вскоре сможем идентифицировать гены, которые контролируют экспрессию этих генов-маркеров."

Следующими шагами будут подтверждение того, что эти маркеры являются хорошими предикторами восприимчивости к болезни в полевых условиях, и начало тестирования, показывают ли некоторые британские деревья, оказавшиеся на пути распространения болезни, аналогичные генетические паттерны, связанные с низкой восприимчивостью.