Разработан доступный метод генетической диагностики для анализа целевой ДНК

Профессор Хён-Гю Пак из KAIST разработал методику анализа различных целевых ДНК с помощью аптамера — фрагмента ДНК, способного распознавать и связываться с определённым белком или ферментом. Эта технология позволит создать доступные генетические тесты для новых бактерий или вирусов, таких как MERS. Результаты опубликованы в июньском выпуске журнала Chemical Communications и выбраны в качестве ведущей статьи.

Проблема существующих методов

Традиционная генетическая диагностика на основе молекулярных маячковых зондов (molecular beacon probes) требовала нового зонда при каждой мутации целевой ДНК, что делало анализ различных фрагментов дорогим.

Суть новой технологии

Команда профессора Пака создала аптамер, связывающий и деактивирующий ДНК-полимеразу. Метод использован «наоборот»: аптамер не связывается с полимеразой (оставляя её активной) только в присутствии целевой ДНК.

Как это работает

Контролируемая активация и деактивация ДНК-полимеразы позволяет удлинять или сокращать нуклеиновую кислоту, что даёт возможность измерять флуоресцентные сигналы от зондов TaqMan. Один и тот же зонд можно использовать для детекции различных целевых ДНК.

Преимущества

• В отличие от метода molecular beacon probe, не требует нового зонда для каждой мишени.
• Использует один флуоресцентный TaqMan-зонд, который дешевле и проще в детекции.
• Позволяет обнаруживать множество различных фрагментов нуклеиновых кислот.

Перспективы

Технология сделает процесс идентификации чужеродных ДНК патогенов (вирусов, бактерий) более доступным и простым.

Цитата исследователя

«Эта методика позволит нам разрабатывать более простые диагностические наборы для новых патогенов, таких как MERS, обеспечивая более быстрый ответ на различные заболевания. Наша технология также может быть широко применена в области генетической диагностики».