FAEVEr: новая платформа для выделения и анализа внеклеточных везикул

Исследователи из VIB‑UGent Center for Medical Biotechnology разработали новый метод выделения и анализа внеклеточных везикул (EVs) — наноразмерных частиц, секретируемых клетками и участвующих в межклеточной коммуникации и развитии заболеваний. Метод, названный FAEVEr (Filter‑Aided Extracellular Vesicle Enrichment), увеличивает пропускную способность обогащения EVs и значительно более экономичен, чем существующие методы. Исследование опубликовано в Journal of Extracellular Vesicles.

Проблема выделения EVs

Внеклеточные везикулы несут белки, РНК и другие биомолекулы и перспективны для диагностики и терапии. Однако их выделение из сложных биожидкостей с высокой чистотой и пропускной способностью остаётся сложной задачей из‑за их малого размера (30–150 нанометров). Традиционные методы, такие как ультрацентрифугирование, требуют много времени и ресурсов и имеют низкую пропускную способность.

Суть метода FAEVEr

Метод FAEVEr, основанный на более ранней работе, опубликованной в Molecular & Cellular Proteomics в январе 2025 года, позволяет обогащать EVs из отдельных образцов в миниатюрном 96‑луночном формате с высокой пропускной способностью.

• Эффективность и скорость: Использование 96‑луночных фильтровальных планшетов позволяет параллельно обрабатывать образцы менее чем за 2 часа.
• Ключевой компонент: Для повышения чистоты протеома EVs в промывочные буферы добавляется мягкий и недорогой детергент Tween‑20. Он предотвращает загрязнение фильтрующих мембран и разрушает слабые взаимодействия между EVs и контаминирующими белками.
• Доступность: Улучшение чистоты не требует сложной химии или дорогих реагентов, что делает метод доступным для лабораторий и клинических исследований со стандартным оборудованием.

Как отметил первый автор исследования доктор Ярне Паувелс: «Мы заметили, что добавление более высоких концентраций Tween‑20 привело к заметному снижению контаминирующих не‑EV белков и значительному увеличению идентификации трансмембранных белков — ключевого показателя в наших исследованиях».

Перспективы для клинической практики

Новый метод прокладывает путь к более воспроизводимой EV‑протеомике и укрепляет основу для будущего клинического применения EVs в диагностике.

Профессор Крис Геварт, директор центра, добавил: «Мы надеемся, что этот новый подход найдёт свой путь в клиническую практику. FAEVEr снижает барьер для обогащения EVs и предлагает значительно более быстрый и экономичный подход к анализу биопсий плазмы или мочи на биомаркеры. Мы надеемся, что эта технология сможет способствовать более быстрой диагностике для пациентов».

Метод уже применяется в исследованиях рака простаты, где анализ обогащённых EVs может помочь идентифицировать специфичные для заболевания белковые сигнатуры из простого образца мочи.