Высокочувствительная эпигеномная технология для борьбы с болезнями

Исследователи из Виргинского политехнического института разработали новую технологию для изучения того, как человеческий организм борется с болезнями, от рака до шизофрении.

В статье, опубликованной в Nature Protocols, профессор Чан Лу и его команда описали микрофлюидную технологию MOWChIP-seq (microfluidic oscillatory washing-based chromatin immunoprecipitation followed by sequencing).

Ключевые преимущества технологии:

• Сверхнизкий входной материал: позволяет характеризовать эпигеном, используя всего 100 клеток на анализ.
• Высокая пропускная способность: возможность параллельной обработки до 8 образцов за один запуск.
• Автоматизация: полуавтоматизированный процесс повышает воспроизводимость и снижает трудозатраты.

Ранее для аналогичных анализов требовались десятки миллионов клеток. Технология MOWChIP-seq позволяет создавать профиль гистоновых модификаций при минимальном количестве биоматериала.

"Сравнивая нормальный и болезненный эпигеномы, можно обнаружить полезные маркеры и паттерны для использования в персонализированной медицине", — пояснил Чан Лу.

Эта работа развивает технологию, впервые описанную в Nature Methods в 2015 году и защищённую патентом США. Новый протокол детализирует автоматизацию процесса и параллельную обработку образцов.