eDNA выявляет места скопления исчезающих птиц

Впервые австралийские учёные показали, что экологическая ДНК (eDNA) можно использовать для обнаружения исчезающего вида птиц, просто собрав чашку воды из водоёмов, где они пьют.

Исследователи из Университета Чарльза Дарвина, Университета Западной Австралии и Департамента окружающей среды и природных ресурсов Северной территории разработали генетический зонд, который нацелен на eDNA исчезающего золотистогрудого астрильда (Erythrura gouldiae) — радужно окрашенной травяной амадины, эндемика саванных редколесий северной Австралии.

Тест eDNA может значительно расширить знания о распространении и использовании среды обитания этими птицами, что важно для принятия решений по управлению землями для восстановления диких популяций.

Когда-то золотистогрудые астрильды тысячами обитали от региона Кимберли в Западной Австралии до полуострова Кейп-Йорк в Квинсленде. Их исторический спад связан с расширением пастбищного хозяйства и изменением режима пожаров, что, вероятно, сократило доступность семян трав — основы их рациона. Поскольку птицы живут небольшими группами на обширных, удалённых и малонаселённых территориях, исследователям сложно предсказать, где и когда их можно встретить, что затрудняет отслеживание динамики численности.

Однако одно поведенческое предсказать можно: этим зерноядным птицам нужно пить воду каждый день. По мере прогрессирования сухого сезона подходящие водоёмы становятся меньше и реже. Концентрированная активность стай у сокращающихся водопоев повышает вероятность попадания следовых количеств их ДНК в воду.

Исследователи разработали двойной тест eDNA, который использует праймер ПЦР для амплификации фрагмента митохондриальной ДНК, общей для астрильдовых, и видоспецифичный зонд для обнаружения ДНК именно золотистогрудого астрильда. Эти птицы часто пьют в смешанных стаях с другими астрильдовыми.

Тест испытали в вольерах Territory Wildlife Park, а затем в полевых условиях на холмах Иньберри возле Кэтрин, где с 1996 года ведётся мониторинг этих птиц, что позволило проверить результаты eDNA по данным традиционных учётов.

Исследование, опубликованное в Endangered Species Research, показало, что eDNA золотистогрудого астрильда можно надёжно обнаружить в 200 мл образца воды, взятого из водопоя, который птицы посещали в течение предыдущих 48 часов. В водоёмах с наибольшим числом птиц ДНК оставалась обнаруживаемой даже через 14 дней после сбора образца, независимо от того, хранился ли он при комнатной температуре или в холодильнике. Сейчас идут более масштабные полевые испытания для отработки протоколов.

Наличие надёжного и точного теста eDNA означает, что индейские рейнджеры, другие управляющие землями и учёные смогут собирать пробы воды попутно, во время других работ на территории, что позволит охватить гораздо большую площадь.