Новый инструмент eDNA помогает учёным находить глубоководные кораллы

Исследователи из Университета Кёртина разработали перспективный новый набор инструментов для мониторинга находящихся под угрозой коралловых экосистем. Он основан на анализе экологической ДНК (eDNA), извлечённой из вод у побережья Кокосовых (Килинг) островов.

Коралловые рифовые системы крайне уязвимы для деятельности человека и экологических стрессов. По оценкам, треть рифообразующих, или склерактиниевых, кораллов внесена в повышенные категории угрозы в Красном списке Международного союза охраны природы (МСОП).

Склерактиниевые кораллы играют ключевую роль в морских экосистемах, обеспечивая среду обитания и пищу для многих видов. Они также защищают береговую линию от эрозии.

Исследователи изучили потенциал метода eDNA-метабаркодинга для оценки биоразнообразия кораллов как альтернативы трудоёмким визуальным подводным исследованиям с аквалангом.

В лаборатории TrEnD Университета Кёртина был проанализирован генетический материал из 90 профильтрованных проб поверхностной воды с Кокосовых островов. Это первый случай применения eDNA-метабаркодинга для анализа кораллов в мегаразнообразном центрально-индо-тихоокеанском регионе.

Пробы воды фильтровались, замораживались и доставлялись в Перт, где из них экстрагировали eDNA. Полученные последовательности анализировали на суперкомпьютерах центра Pawsey для идентификации видов.

Сравнение данных eDNA с результатами визуальных наблюдений показало, что эти методы высоко дополняют друг друга. Успешное обнаружение склерактиниевых кораллов в пробах eDNA подтверждает, что этот метод перспективен для исследования морского биоразнообразия.

Исследование "Development of a multi-assay approach for monitoring coral diversity using eDNA metabarcoding" опубликовано в журнале Coral Reefs.