Распутывание ДНК каплей воды, пипеткой и полимером
Химики и инженеры из KU Leuven (Бельгия) разработали простой и эффективный метод для распрямления и визуализации длинных фрагментов ДНК под микроскопом. Техника описана в журнале ACS Nano.
Суть метода
Метод, названный «техникой катящейся капли», включает несколько шагов:
- ДНК помечается флуоресцентным красителем (фторокодирование).
- Материал вводят в каплю воды с небольшим количеством кислоты.
- Каплю наносят на стеклянную пластину, покрытую липким полимером Zeonex.
- Кончиком пипетки каплю прокатывают по пластине. Капля катится как шарик, при этом ДНК прилипает к поверхности полимера.
- Распрямлённую ДНК изучают под флуоресцентным микроскопом.
Преимущества перед предыдущим методом
Ранее использовалась техника испарения капли, но она была сложной и не всегда давала длинные прямые фрагменты ДНК, идеальные для DNA mapping (картирования ДНК). Новая методика, основанная на внутренней динамике потока в капле и свойствах полимера Zeonex, позволяет получать более длинные и прямые молекулы.
Проверка эффективности
Исследователи протестировали метод на ДНК вируса с известной длиной. Длина ДНК, зафиксированной с помощью «катящейся капли», совпала с известной длиной вирусной ДНК.
Потенциальное применение
- Клиническая диагностика: Быстрое определение типа инфекции (вирусная или бактериальная) благодаря малому количеству исходного материала и скорости анализа.
- Исследования: Метод применим не только к вирусной, но и к человеческой или бактериальной ДНК.
- Онкология: После доработки методика может помочь в быстрой дифференциации здоровых и раковых клеток.