Инструмент на основе ДНК позволяет отследить древнее происхождение
Ученые из Университета Шеффилда, изучающие древнюю ДНК, создали инструмент, позволяющий точнее идентифицировать древние евразийские популяции. Его можно использовать для определения степени сходства отдельного человека с древними народами.
Сейчас для классификации скелета по популяции или определения его биогеографического происхождения на основе древней ДНК требуется много информации.
Ученые определили новую концепцию — Древние маркеры, информативные для происхождения (aAIMs). Это группа мутаций, достаточно информативная для идентификации и классификации древних популяций.
Исследование под руководством доктора Эрана Эльхаика выявило небольшую группу aAIMs, которую можно использовать для классификации скелетов по древним популяциям.
Доктор Эльхаик заявил: «Мы разработали новый эффективный метод поиска aAIMs и доказали его точность».
Маркеры, информативные для происхождения (AIMs), давно используются в науке, в том числе в здравоохранении и судебной экспертизе в течение последнего десятилетия.
Однако, по словам доктора Эльхаика, когда его команда применила традиционные инструменты поиска AIMs к данным древней ДНК, их точность оказалась низкой.
«Древние популяции были гораздо более разнообразны, чем современные, — сказал он. — Их разнообразие сокращалось с годами после таких событий, как неолитическая революция и Черная смерть. Хотя сегодня людей гораздо больше, все они гораздо более похожи друг на друга, чем древние люди. Кроме того, сами древние данные проблематичны из-за большого количества деградировавшей ДНК».
Чтобы преодолеть эти проблемы, доктор Эльхаик разработал специализированный инструмент, который идентифицирует aAIMs, комбинируя традиционную методологию с новой, учитывающей смешение.
«Древние геномы обычно состоят из сотен тысяч, а иногда и миллионов маркеров. Мы показали, что для точной классификации популяций по древним геномам необходимо всего 13 000 маркеров. И хотя области древней судебной экспертизы пока не существует, эти aAIMs могут помочь нам стать гораздо ближе к древним людям».
Он добавил: «До сих пор нельзя было тестировать людей на древнюю ДНК, потому что коммерческие микрочипы, такие как те, что используются в генетической генеалогии, не имеют многих маркеров, релевантных для палеогеномики — люди не могли изучать свое первобытное происхождение. Обнаружение aAIMs похоже на поиск отпечатков пальцев древних людей. Оно позволяет протестировать небольшое количество маркеров — которые можно найти в общедоступном чипе — и спросить, какая часть вашего генома происходит от римских бриттов, викингов, индейцев чумаш, древних израильтян и т.д. Мы можем задавать любые вопросы об этих древних людях, если кто-то секвенировал эти древние маркеры. Таким образом, эта статья открывает область палеогеномики для широкой публики».
Исследователи заявили, что для повышения точности выводов исследования в идентификации и классификации древних людей по всему миру, его рамки и методы следует применять повторно, когда появятся более полные базы данных древней ДНК.
Полное исследование «Ancient Ancestry Informative Markers for Identifying Fine-Scale Ancient Population Structure in Eurasians» опубликовано в журнале Genes.