Две независимые группы открыли ингибиторы CRISPR-Cas12a

Две исследовательские группы независимо друг от друга идентифицировали несколько ингибиторов CRISPR-Cas12a. Первая группа состояла из учёных Калифорнийского университета в Беркли, вторая — из специалистов Массачусетской больницы общего профиля и Калифорнийского университета. Обе команды использовали биоинформатические инструменты для поиска потенциальных ингибиторов в бактериальных геномах и опубликовали результаты в журнале Science.

CRISPR — это техника редактирования генов, которая может находить сегменты ДНК и вырезать их из генома, а также заменять удалённые фрагменты. Для выполнения своей работы CRISPR использует нуклеазу (например, белок Cas), которая служит шаблоном, указывающим, какие гены нужно вырезать или заменить. В ранних исследованиях часто использовали Cas9, и его работа требовала добавления ингибитора Cas9, чтобы предотвратить нецелевое разрезание. В последнее время исследователи применяют Cas12a, так как он обладает желаемыми характеристиками, отсутствующими у Cas9. Однако до сих пор не было известно ингибиторов для Cas12a, что ограничивало его использование. В новых работах обе группы нашли несколько ингибиторов, пригодных для применения с CRISPR.

Обе команды использовали биоинформатический пайплайн для поиска ингибиторов Cas12. Этот метод предполагает сканирование бактериальных геномов в поиске генетических фрагментов, которые обычно летальны для бактерий, но не действуют на бактерии, имеющие ингибиторы. Первая группа обнаружила три ингибитора, включая особенно эффективный — AcrVA1. Тесты на человеческих клетках показали, что все три можно использовать с CRISPR. Вторая группа, применяя аналогичный подход, также нашла несколько кандидатов, успешно работающих на человеческих клетках, и подтвердила высокую эффективность AcrVA1.

В совокупности работы двух групп предоставили несколько потенциальных ингибиторов Cas12a, один из которых выглядит особенно перспективным. Это открытие может привести к более продуктивным исследованиям с использованием CRISPR-Cas12a в качестве нового инструмента редактирования генов.