Разработан новый электрохимический биосенсор для прогноза рака
Исследователи из Nano Life Science Institute (WPI-NanoLSI) Университета Канадзавы сообщают в Biosensors and Bioelectronics: X о новом методе обнаружения биомолекулы ADAR1, связанной с несколькими заболеваниями. Результаты показывают хорошую чувствительность и селективность и могут привести к созданию недорогого устройства для быстрого обнаружения, полезного в прогнозе рака.
Одна из модификаций транскрипции — редактирование аденозина в инозин, при котором аденозин химически модифицируется. Этот тип модификации осуществляется каталитическими белками ADAR (аденозиндезаминазы, действующие на РНК).
Один из них, ADAR1, в большем количестве присутствует при нескольких хронических заболеваниях, включая неврологические расстройства и рак. Поэтому ADAR1 считается биомаркером для оценки состояния пациента и шансов на выживание.
Мадху Бияни и коллеги разработали новый электрохимический биосенсор для обнаружения ADAR1, предлагающий недорогой и быстрый инструмент для измерения концентраций ADAR1 в клетках. Детектор ожидается полезным для мониторинга прогрессирования рака.
Новизна подхода:
- Использование вновь идентифицированных аптамеров в качестве молекул, распознающих и захватывающих ADAR1. Аптамеры — это синтетические последовательности ДНК или РНК, связывающиеся с конкретной мишенью.
- Применение портативного электрохимического сенсора DEPSOR (BioSeeds Corp.), который отличается быстротой, низкой стоимостью и требует малых объемов образца.
Ход исследования:
- Из большого набора последовательностей ДНК было отобрано 15 кандидатных аптамеров.
- Каждый кандидат тестировался на электрохимической платформе: количество ADAR1 «ощущается» через химические реакции, приводящие к электрическому току. Чем больше ADAR1 в образце, тем выше измеряемый ток.
- Аптамер Apt38483, дающий самый высокий электрохимический отклик, был проверен далее. Его реакция на «ложные» белки была очень низкой, что подтвердило его оптимальность по чувствительности и селективности.
Результаты:
- Прототип устройства на основе Apt38483 тестировался на разбавленных клеточных образцах.
- Даже в образце, разбавленном в 625 раз, ADAR1 всё ещё мог быть обнаружен, что подчеркивает высокую чувствительность устройства.
Перспективы:
Разработанный биосенсор — многообещающая платформа для мониторинга прогрессирования рака в клинических образцах. Ученые заявили: «В будущем будет перспективно оценить систему для идентификации низкого и высокого уровня экспрессии ADAR1 в образцах раковых клеточных линий для клинического прогноза».
