Два ведущих центра биологической визуализации предлагают мощный бесплатный онлайн-инструмент
Два ведущих ресурса по клеточным изображениям объединились, чтобы создать расширенную и продвинутую платформу для архивирования, обмена и детального анализа микроскопических изображений. Американское общество клеточной биологии (ASCB) и Национальный центр микроскопии и исследований изображений (NCMIR) Калифорнийского университета в Сан-Диего (UCSD) объединили усилия, предоставив единый интерфейс. Это объединение расширяет возможности сайта ASCB The Cell: An Image Library новой функциональностью и расширяемой программной инфраструктурой.
Объединённый ресурс теперь будет поддерживаться NCMIR через его Cell Centered Database. Он позволит пользователям делиться и интерактивно изучать чрезвычайно большие файлы изображений молекулярной и клеточной биологии, создаваемые с помощью передовой микроскопии и других новых методик. Помимо содействия сотрудничеству между исследователями, The Cell: An Image Library открывает захватывающий микроскопический мир многомерных и высокоразрешающих изображений для студентов и всех, кто интересуется изучением жизни на клеточном уровне. Ресурс доступен по адресу www.cellimagelibrary.org.
Полезной новой функцией этого недавно улучшенного сайта является инструмент NCMIR Web Image Browser (WIB). Он предоставляет исследователям и студентам беспрецедентный доступ к сверхвысоким разрешениям изображений с простыми инструментами для совместной разметки и аннотирования данных. Также предлагается новый онлайн-загрузчик изображений для упрощения загрузки новых изображений и связанных с ними метаданных без ограничения по размеру.
Зарегистрировав бесплатный аккаунт, пользователи могут сохранять изображения для будущего использования, определять области интереса и создавать персонализированную домашнюю страницу для организации, обмена и отслеживания новых изображений, связанных с этими областями.
Благодаря этому сотрудничеству ASCB и NCMIR предлагают учёным расширяемый и универсальный биомедицинский инструментарий для хранения, обмена и анализа данных с множеством связанных опций.
"Все исследователи получат большую пользу от наличия одного ресурса, где они могут как архивировать, так и находить полезные иллюстративные изображения. Более того, я считаю, что обществу будет полезен простой в поиске репозиторий клеток с открытым доступом", — заявила Сандра Шмид, президент ASCB.
Запланированные улучшения позволят пользователям напрямую связываться с другими исследователями и создавать частное пространство для сотрудничества в The Cell: An Image Library. Ключевым аспектом всей работы станет создание связей с другими базами данных изображений и клеточной биологии, чтобы The Cell стал центром федеративной исследовательской сети. Это обеспечит доступ ко многим ресурсам через единый портал.
Ресурс будет использовать технологии, разработанные UCSD и партнёрами для проекта Neuroscience Information Framework (NIF). NIF предоставляет технологии для объединения баз данных разных масштабов и методик в рамках общей семантической структуры.