Улучшенный метод поиска белков-мишеней для новых лекарств

Химические биологи из RIKEN разработали простой и эффективный метод идентификации белков, взаимодействующих с биологически активными молекулами. Инновация, описанная в ChemBioChem, может ускорить разработку новых препаратов.

Почему это важно? Биоактивные молекулы (малые — природные и синтетические, и крупные, например, антитела) — перспективные кандидаты для создания лекарств. Понимание их механизма действия через идентификацию белков-мишеней — ключевой этап разработки.

Суть метода: Ранее Акира Вада создал метод, где белки синтезируются рибосомной машинерией из mRNA, процесс трансляции останавливается, и образуется комплекс «белок–mRNA–рибосома». Комплексы, связавшиеся с исследуемой молекулой, отбираются, а их mRNA амплифицируется для идентификации белка.

Проблемы старого метода: низкое разнообразие пула белков и неспецифическое связывание комплексов с молекулой.

Улучшение: Исследователи использовали ДНК и mRNA одинаковой длины. Это позволило:

• Создавать пулы с разнообразными белками разного размера.
• Повысить оперативность и точность метода, обеспечив отбор только специфически связавшихся комплексов.

Результаты: Улучшенный метод успешно идентифицировал белки-мишени, которые не удавалось найти с помощью предыдущей версии.

Перспективы: Метод не требует дорогого оборудования и может применяться не только для поиска мишеней биоактивных молекул, но и для изучения новых взаимодействий между известными белками и их неизвестными партнерами. Это может внести вклад в понимание рака, иммунодефицитов и неврологических заболеваний.