Бактериофаг PAK_P3 кардинально меняет метаболизм РНК при заражении синегнойной палочки

Исследовательская группа под руководством Роба Лавиня из Лёвенского университета (Бельгия) и Лорана Дебарбьё из Института Пастера (Франция) с помощью метаболомики и транскриптомики показала, как бактериофаг, поражающий оппортунистическую бактерию Pseudomonas aeruginosa, использует РНК хозяина для собственной репликации. Результаты опубликованы 5 июля 2016 года в PLOS Genetics.

Фаговая терапия, использующая природные вирусы для лечения бактериальных инфекций, рассматривается как альтернатива антибиотикам, но жизненные циклы большинства фагов плохо изучены. Учёные проанализировали РНК-транскрипты и метаболиты бактерии и вируса PAK_P3 в ходе инфекции.

Ключевые выводы:

• Фаг вызывает быстрое разрушение бактериальных РНК.
• Затем он утилизирует высвободившиеся пиримидиновые нуклеотиды для собственного использования.
• PAK_P3 также использует РНК-стратегии для регуляции экспрессии своих генов, включая антисмысловые транскрипты и малые некодирующие РНК.

Исследование подчёркивает центральную роль метаболизма РНК в стратегии заражения этого бактериофага. PAK_P3 представляет новую группу вирусов с перспективными для терапии характеристиками, а его хозяин, P. aeruginosa, часто обладает множественной лекарственной устойчивостью. Для эффективного медицинского применения фагов необходимо детальное понимание их жизненных циклов.